Действие фильма «Инквизитор от Бога» происходит в современной России и в других странах и временах.
Алексей Катин и Константин Обручников дружат с детства. С самого рождения происходят странные случаи, в которых Лёша становится причиной многих неприятностей Кости.
Обручников — гениальный, непризнанный режиссёр и сценарист.
Катин — простой человек, но к нему приходит осознание, что он — избранный Богом Инквизитор, который из поколения в поколение казнит праведников и гениев рода человеческого.